Commissions organiques
Pour la préparation des décisions qui lui incombent et des affaires qui lui sont soumises, l'Assemblée de Corse s'organise en 3 commissions organiques entre lesquelles sont distribués tous les dossiers selon leur objet. Les membres des commissions organiques sont désignés à la représentation proportionnelle au plus fort reste des groupes.
Commissions thématiques
Le règlement de l'Assemblée de Corse prévoit par ailleurs les commissions thématiques suivantes :
Commission ad hoc
Lorsque la nature d’une affaire qui lui est soumise l’exige, l’Assemblée de Corse peut décider, à l’initiative de sa Présidente ou à la demande d’un cinquième de ses membres, la création d’une commission ou d’un groupe de travail ad hoc. Elle en détermine la durée, la composition et la mission.